La Guerra de los Clones terminó, pero la paz no ha llegado... Hunter, Echo, Tech, Wrecker y Crosshair forman parte de un escuadrón de soldados clon defectuosos, conocido como la Fuerza Clon 99 o el Lote Malo. Sus deficiencias van acompañadas de talentos muy particulares y los convierten en una brigada de élite para la República. Sin embargo, cuando reciben la orden de eliminar a todos los Jedi, deciden desobedecer y escapan con la ayuda de una joven clon llamada Omega.